id:syou6162のデータを、本業、というか、奈良（！）なんだけど、に送付。 本当は、みんな顔を揃えて、とかがいいんだろうけど、そうでもないからね。媒介者として間違いを起こさないように、代弁して。 これでいろいろまわりはじめたりすると、いいんだけど…

うっかり、17日と18日と間違えて書いてしまった。コメントがあるから動かせないな。というわけで、取り繕ってみる。（すまん）。以下は、本当に18日。

ビューティフルコード (THEORY/IN/PRACTICE)を立ち読みしてきました。軽く。いや、こいつ33章もあるんで。ビューティフルコード (THEORY/IN/PRACTICE)作者: Brian Kernighan,Jon Bentley,まつもとゆきひろ,Andy Oram,Greg Wilson,久野禎子,久野靖出版社/メー…

年度末だからね、というか、年度が変わる時期だからね。 鉛筆なめなめってところでしょうか。 あまりこういう仕事は得意ではないんですが。。。

同じ部屋の人から泣きが入ったので眺めてみる。 Firefoxだと、divタグで形成された箱の中に画像があれば、その画像の高さに合わせて箱の高さが変動する。 Google Chromeだと、divタグで形成された箱は箱として（仮想的に）描画され、画像がその高さより高い…

てなわけで、裏でParseを始めてみました。昨日 入れた、BioPerl利用。こういうスクリプトも公開した方がいいんかな。 MEDLINE中に、他のDB（GenBankとかOMIMとかPDBとか）のIDが登録されているところがあるので、それとPMIDとかをペアにして出す、というもの…

月に2度くらいの全体会議の日なので、例によって、エクセル@Winいじり。 ま、今日は、こういう事務作業に明け暮れよう（そして早めに帰ろう）と思っていたので。

確か、MEDLINEって、ほどくと数十GBだった気がする。自分のマシンにそんなスペースはないので、某マシンに。で、BioPerlでParseするべー（どこの人?）しようと思ったのだが、そういえば、BioPerlが入っていないんだった。とつぶやいたらば、許可が出たので、…

何の縁をもってか、と言えば、どこぞでとっつかまえて、そいつを標本にした上に、使えるだろうと写真を撮って、かつ、ちょっとPhotoshopが詳しい、という縁ですが、 私が作りました。作ってくれ、と にっこりされたので。。。（−＿−； 元は、 みたいな画像。…

解読作業。

そりゃぁ、日本は9日でも、向こうは8日ですから。 入ってしかけておく。以上。

第2弾。 前のは、模様が一様だったから簡単だったけれども、今回のは、データが欠けているわ、色を直さんといけないわ、なんやらかんやら。 ま、自己満足ですよ。 今度から、元ファイルを渡すからあとはよろしく、とか言ってみよう。

Gendoo - Gene, Disease Features Ontology-based Overview Systemのデータをアップデートするための（今のところ）年に一度の元データ集中ダウンロードデイ。 一応、つっつくスクリプトはこさえてあるので、始めておく。しかしながら、年に一度でどれをやれ…

ダウンロードしてみたら、文字化けがひどいものがいくらか混じっていた、というのが、前回までの話。しょーがねーなー、と、ブラウザでサイトを訪れてみるが、その時点で化けていた。同じのをプログラムで見るかブラウザで見るかの違いだが、ブラウザの賢さ…

さほど難しくはないだろうと想像していたが、難しい仕事ではなかった（コワザは織り交ぜたが）。 データをきちんととっていないと、それを解析して結果を出そうとしたってそう簡単に出るもんじゃない。逆に、データをしっかりとっていれば、何か出てくる。そ…

昨日、うっかり始めちゃったけど、24時間かかるかも、と書いたのだが、24時間では終わらなかった。。。（結局、28時間くらいかかったと思われる）。 ただ、すでにいくらかは落としてあるので、中身をパースするのは可能なわけで、いくらか眺め始めて、HTMLの…

2009-12-07 - chalk-less::weblog::theclaに書いたとおり、この1月1日から、著作権法改正により、検索エンジンとか、テキストマイニング研究のためにデータを落とすのに仁義をきらなくてよくなったので、さっそく。 アブストだけだけれども、途中でHTMLペー…

grepするあたりは、時間がかかりそうだったので、投げて帰ったのだが、朝 来たら終わっていた。 眺めてみたけれども、書いたとおりで、短い単語はgrepすると何回も出てきて、ノイズっぽい感じが。うまいこと足切りせんといかん気がする。 とまぁ、のんびり書…

正月にぼちぼち眺めてはみたものの、もう少しどうにかしないとなー（必要なものを入れるとか、ノイズをキュレーションするとか）、と思っていたのだが、なんかそうもいかない感じになりつつあるので、とりあえず出すことにした。 当初は、mecabの辞書仕立て…

返事が来た。 2009-12-28 - chalk-less::weblog::theclaで、こんな論文があったけど、お前の方がいいのか、みたいに言われた、という論文について、特に言及していなかったのだが、 A large-scale analysis of tissue-specific pathology and gene expressio…

何事もなかったかのように、普通の月曜日。

今年もよしなに。げしげしやるべし。 今年の年賀状（電子バージョン）。寅耳編で。 （http://lifesciencedb.jp/lsdb.cgi?gg=resource_icon 使いました）