short read archiveのデータってeutilsで取れるんかな

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NCBI SRA (Short Read Archive)のデータをeutilsとかで取れると、それを使ってちゃらちゃらーという流れなのだが、そもそもどうなのか。
まぁ、各シーケンスのデータは巨大なので、そういうのは、FTPサイトからとればよいと思うのだが。ここでやろうというのは、Submission とか、Experiment とか、Sampleとか、Runとか、そういう情報。
定番は、esearch → efetchの流れ。とりあえず、web経由で手入力してみたのを参考にesearch。http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi?db=sra&term=all[sb]&retmax=30&usehistory=y


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 0
 1
 
  0r5F8fTHugVqVVuRl9LwYHTusRZ46CCFAFsWqjPcEuAnEdIXG1c3_K0Xfv@CE8F500AA78EF0C1_0032SID
 
 
  7419
  7418
  7417
  ...
  7319
  7318
 
 
 
  
   all[sb]
   sb
   6373
   Y
  
  GROUP
 
 all[sb]

とれましたねぇ。
これを元にefetch。でも、efetchのヘルプのページに飛ばされるなぁ。
そもそもIdがSRX007153とかでなくて、7419とかいうのがわからん。というわけで、ブラウザで。なるほど。このSRX007153というアクセッション番号の ID （GenBankとかでいうところの gi number）が7419なのね。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=sra&Cmd=DetailsSearch&Term=7419[uid]
午後もぼちぼちもう少し調べてみるか。