2009-08-05から1日間の記事一覧

short read archive でのデータ転送

最近、http://trace.ddbj.nig.ac.jp/dra/index.shtmlができたわけですが、Overview : Main : Sequence Read Archive : NCBI/NLM/NIHとか、http://www.ebi.ac.uk/embl/Documentation/ENA-Reads.htmlもあり。つらつら眺めている。 と、NCBIでもEBIでも、Aspera…

どんな生物種がどこに出てくるかデータのアップデート の つづき

thecla@g86:~/Sites/tmp$ cat mapping.090626.txt mapping.090804.uniq.txt | wc -l 670989 thecla@g86:~/Sites/tmp$ cat mapping.090626.txt mapping.090804.uniq.txt | sort | uniq | wc -l 406434 thecla@g86:~/Sites/tmp$ wc -l mapping.090626.txt 4018…