論文でました
Gendoo: Functional profiling of gene and disease features using MeSH vocabulary Takeru Nakazato, Hidemasa Bono, Hideo Matsuda and Toshihisa Takagi Nucleic Acids Research, doi:10.1093/nar/gkp483 http://nar.oxfordjournals.org/cgi/content/full/gkp483 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19498079
Nucleic Acids Research の Web Server Issue に載ります。
メッセージ送ってくれた方、どうもありがとうございます。
いろいろノウハウをウェブから教わったので、逆にここに書くことで恩返しできたらなぁ、などとも思います。