論文でました

Gendoo: Functional profiling of gene and disease features using MeSH vocabulary
Takeru Nakazato, Hidemasa Bono, Hideo Matsuda and Toshihisa Takagi 
Nucleic Acids Research, doi:10.1093/nar/gkp483 
http://nar.oxfordjournals.org/cgi/content/full/gkp483
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19498079

Nucleic Acids Research の Web Server Issue に載ります。
メッセージ送ってくれた方、どうもありがとうございます。
いろいろノウハウをウェブから教わったので、逆にここに書くことで恩返しできたらなぁ、などとも思います。